どちらも日本でいうと４年生の大学です。ちなみに、日本の４年制の大学卒＝学士号の取得ですが、海外の大学では、この資格を「Bachelor」といいます。ですので、海外の大学進学する際には、勉強する機関や学校ではなく、「なんの資格を取得できるか」で選ぶのが大事です。
例えば、ドイツでは、学士号を取得するのは３年～３年半ですし、必ずしも「University」でなくても「学士号」は取得できます。
本題に戻りますが、このHochschule(Fachhochschule・・・大学名だと、○○Hochschuleとなるので)とUniversität の違いについて説明します。
これはどちらも大学ですが、ドイツの大学にはこの二つの種類があります。
Universität は、歴史的な大学が多く、また授業内容は講義が多いタイプです。学部も、哲学、言語学、医学、薬学、法学などは主にUniversität になります。Universität は、入学の制限が厳しく、ドイツではギムナジウムからのみ入学が許されます。（ギムナジウムの説明は下方にまとめました。）
一方でHochschule(Fachhochschule)は、専門的な分野を勉強する大学で、講義よりもどちらかというと、実践的な授業が多く、現に多くの場合、卒業までに半年間は企業や工場などでインターンシップをします。学部は、エンジニア、ビジネス、マーケティング、IT系などが多いです。
Universität のほうがレベルが高い、企業からのイメージが良く就職しやすいなどと思われる方もいるかもしれませんが、実際にはそんなことはありません。実は近年ではHochschuleのほうが人気があり、業種によっては、Hochschule卒のほうが即戦力になるので採用されやすいということもあります。
＊ギムナジウムについて：ドイツでは10歳になるときにすでに学業レベル別にHauptschule、Realschule、Gymnasiun３段階に学校に分けられます。
Gymnasiunは一番上で、Universität にはGymnasiunからしか上がれません。Realschuleに行った場合は、卒業後に大学へ行くための予備校的な学校に行き、大学進学資格（Abitur）を取得してから大学に行きますが、Universität ではなく、Fachhochschuleにしか行けません。
Schulsystem in Deutschland. Berufsschule. Fachhochschule. Universität/ Fachhochschule. 18 Jahre. Gymnasium. 16 Jahre. Realschule. 15 Jahre. Hauptschule. 10 Jahre. Grundschule. 6 Jahre. Kindergarten. 3 Jahre.